فرودگاه بینالمللی امام خمینی(ره) در سال ۱۳۸۴ با یک ترمینال مسافری و ظرفیت پذیرش ۶.۵ میلیون مسافر به بهرهبرداری رسید. با شروع فعالیت آن، پروازهای بینالمللی از مبدا و به مقصد تهران به این فرودگاه منتقل شد. به موجب قانون برنامه پنجم توسعه، مقرر شد با هدف تقویت موقعیت کشور در شبکه حمل و نقل هوایی بینالمللی و افزایش درآمد ناشی از ترانزیت و حمل و نقل مسافر و کالا و همچنین کسب درآمدهای غیرهوانوردی، فرودگاه بینالمللی امام خمینی(ره) به شهر فرودگاهی امام خمینی(ره) تبدیل شود. با تصویب اساسنامه شرکت در سال ۱۳۹۲ توسط هیئت محترم دولت، این فرودگاه به عنوان یکی از شرکتهای تابعه وزارت راه و شهرسازی و با تکالیفی همچون:
• ایجاد و تکمیل زیربناها و زیرساختهای لازم با اولویت احداث فاز دوم فرودگاه بینالمللی امام خمینی(ره)
• ایجاد “شهر فرودگاهی” با تبدیل بخشهایی از اراضی حدود چهارده هزار هکتاری آن به منطقه آزاد تجاری (یکهزار و پانصد هکتار) و منطقه ویژه اقتصادی (دوهزار و پانصد هکتار)
• ایجاد و گسترش مرکز لجستیک (شهر لجستیک) و بندر خشک
این شرکت فعالیت خود را از آذر ماه سال ۱۳۹۴ آغاز نمود. همچنین، طرح جامع شهر با در نظر گرفتن اهداف برنامهریزی شده همچون تبدیل شهر فرودگاهی امام خمینی (ره) به قطب بار و مسافری و لحاظ کردن ملاحظات هوانوردی و لجستیکی، در تاریخ ۱۵ خرداد ماه ۱۳۹۷ به عنوان سند توسعه ۳۰ ساله، به تصویب مجمع عمومی شرکت شهر فرودگاهی و وزارت راه و شهرسازی رسید.